谷歌推出SynthID Bio为AI生成蛋白质加水印
原文:Introducing SynthID Bio
推出 SynthID Bio:为 AI 生成蛋白质添加水印,同时保留生物功能的概念验证。今天,我们推出 SynthID Bio,将水印技术带入合成生物学。SynthID Bio 会将一个难以察觉的签名直接嵌入生物代码中,确保水印不仅能在数字模型上验证,也能在合成后的实体蛋白质本身上验证——同时在实验室测试中保留其生物功能。生成式 AI 正在帮助科学家应对关键生物学挑战,从预测蛋白质结构(AlphaFold)到设计全新蛋白质(AlphaProteo 和 ProteinMPNN),再到更近期开发新型噬菌体,也就是感染细菌的病毒。然而,这些工具也带来了新挑战:新颖的 AI 设计可能绕过传统的 DNA 合成筛查,而被错误标注的合成 3D 结构则可能污染公共数据库,并误导下游研究。SynthID Bio 的工作原理:SynthID Bio 是一系列专为合成生物学开发的水印方法,旨在加强生物安全和科学诚信。它会根据数据类型调整方法,微妙地引导序列中氨基酸的选择,并调整预测 3D 结构的原子坐标,从而形成可靠的检测信号。在实验中,这些调整并未损害蛋白质的生物功能,而这一点对于有效治疗疾病和推进科学研究至关重要。我们通过将蛋白质结合体设计方法 AlphaProteo 与启用 SynthID Bio 的 ProteinMPNN(常用的蛋白质序列生成方法)结合使用,验证了为蛋白质结合体添加水印的方法。蛋白质结合体是指被构建为选择性附着到其他蛋白质上的分子。在针对三种目标蛋白(VEGF-A、SARS-CoV-2 刺突蛋白 RBD 和 PD-L1)的湿实验室测试中,我们添加水印的设计在命中率、结合亲和力和天然序列多样性方面都与未